Fusion融合标准品\质控品\参考品

CRO服务

| 基因融合与肿瘤发生

融合基因（fusion gene），是指两个基因的部分序列发生融合形成的嵌合基因，一般由于染色体易位、缺失等原因所致。这种嵌合基因会在后续的生物学过程中形成异常转录本或蛋白质，进而导致或者促进肿瘤的发生。举个例子，慢性粒细胞白血病，其分子生物学特征就是检测到BCR-ABL融合基因；该融合基因翻译出的融合蛋白具有很强的酪氨酸激酶活性，会导致细胞过度增殖、细胞凋亡受抑制，进而出现各种病症。

因此，准确检测出融合基因/转录本，对于这类肿瘤疾病的预防、治疗和全面理解有重要的意义。在实际分析中，我们通过预测的融合基因位点信息，对“表达外显子组”的转录活性区域进行筛选，获取涉及转录序列突变和结构重排的证据，进而找到与其功能相关的癌症基因组的变化。

| 肿瘤分子诊断的发展前景及其标准化

分子诊断技术是肿瘤分子病理研究具有划时代意义的检测手段，拓宽了病理学研究的范围，使我们对肿瘤发生发展、形态特征、生物学行为的认识进入分子水平，分子诊断的大部分技术已日趋成熟。

分子诊断目前仍存在一些问题，由于其技术一般都具有敏感性高的特点，特别是PCR和NGS技术，结果影响因素较多，最大的问题为技术性假阳性和假阴性。要使检测技术具有高敏感性，又要确保检测结果的高特异性和重复性，质量控制至关重要，关键在于建立标准化的实验操作程序和标准化的分子诊断实验室和标准化的诊断指标。

| Fusion标准品细胞株定制

融合基因是肿瘤产生的重要原因，实体瘤中最常见融合基因是酪氨酸激酶（如ALK、ROS1和RET等），融合突变导致下游细胞信号通路激活，细胞无限增殖。融合基因既是导致肿瘤的“魔鬼”，也能成为靶向治疗癌症的天使。多种融合基因的靶向抑制剂在临床肿瘤治疗中效果卓越，是肿瘤靶向治疗的主力军。

海星生物多元的基因编辑工具箱，可以高效的实现染色体的特定编辑：Translocation、Recombination、Inversion、Deletion。编辑后的细胞株断点明确，与天然序列完全一致，可以稳定检出DNA层面、RNA层面、蛋白层面的变异，是测试融合基因检测的灵敏度、特异性和稳定性的优秀标准品。

案例1：Fusion

Copy number：3281.04 copies/ng RNA RNA sequencing:

案例5：Fusion

EML4[13]-ALK[20] inversion DNA sequencing:

| 海星生物HyCyteREF_TM分子诊断标准品特点

· 可再生

· 有类似检测样本的基因组复杂结构（异质性）

· 有明确的拷贝数和等位基因数

· 质量高度稳定、均一性好

· 具有临床标本和肿瘤细胞的特性

· 无伦理风险

| 海星生物HyCyte^TM分子诊断标准品细胞株制备流程

海星生物专注细胞基因编辑（基因敲除\敲入\突变\过表达）十年：为基因检测提供参考品细胞株开发，已经和多家基因诊断公司建立合作。海星生物可以提供诊断试剂盒标准品定制化服务，为客户定制拷贝数固定（或高突变频率）的单核苷酸变异（SNV）、碱基缺失（Deletion）、碱基插入（Insertion）、基因融合（Fusion）、拷贝数变异（CNV）等各种变异类型的标准品细胞株，可应用于基因检测的上游试剂盒研发、企业参考盘注册申报、生产质检，下游ICL的日常质控、EQA支持。解决临床样本有限，稀有突变难获得的问题。还可以订制开发IHC（免疫组化）标准品细胞株，解决细胞系表达丰度不稳定，染色深浅不一的问题。此外针对肿瘤早筛甲基化检测试剂盒，海星生物可以提供低甲基化水平DNA参考物质。

附：常见融合基因位点

ALK融合基因
CAD-ALK Fusion	EML4-ALK Fusion	KIF5B-ALK Fusion	NPM1-ALK Fusion	RANBP2-ALK Fusion	STRN-ALK Fusion

ABL1融合基因
BCR-ABL1 Fusion

BRAF融合基因
BRAF-AGAP3 Fusion	BRAF-AGK Fusion	BRAF-AKAP9 Fusion	BRAF-ARMC10 Fusion	BRAF-CUL1 Fusion	BRAF-FAM131B Fusion
BRAF-GTF2I Fusion	BRAF-KIAA1549 Fusion	BRAF-MKRN1F Fusion	BRAF-PAPSS1 Fusion	BRAF-PCBP2 Fusion	BRAF-PPFIBP2 Fusion
BRAF-SND1 Fusion	BRAF-TRIM24 Fusion	BRAF-ZKSCAN1 Fusion

FGFR2融合基因
FGFR2-AHCYL1 Fusion	FGFR2-BICC1 Fusion	FGFR2-CCDC6 Fusion	FGFR2-CIT Fusion	FGFR2-FAM76A Fusion	FGFR2-KIAA1967 Fusion
FGFR2-MGEA5 Fusion	FGFR2-OPTN Fusion	FGFR2-PPHLN1 Fusion	FGFR2-TACC3 Fusion	FGFR2-ZMYM4 Fusion

FGFR3融合基因
FGFR3-BAIAP2L1 Fusion	FGFR3-TACC3 Fusion	IGH-FGFR3 Fusion

JAK2融合基因
ATF7IP-JAK2 Fusion	BCR-JAK2 Fusion	PAX5-JAK2 Fusion	PCM1-JAK2 Fusion	TEL-JAK2 Fusion

NTRK1融合基因
CD74-NTRK1 Fusion	EPS15-NTRK1 Fusion	LMNA-NTRK1 Fusion	MPRIP-NTRK1 Fusion	NFASC-NTRK1 Fusion	TFG-NTRK1 Fusion
TPR-NTRK1 Fusion

NTRK2融合基因
ETV6-NTRK2 Fusion

NTRK3融合基因
BTBD1-NTRK3 Fusion	EML4-NTRK3 Fusion	ETV6-NTRK3 Fusion	HNRNPA2B1- NTRK3 Fusion	KANK1-NTRK3 Fusion	UBE2R2-NTRK3 Fusion

PDGFB融合基因
PDGFB-COL1A1 Fusion

PDGFRA融合基因
PDGFRA-BCR Fusion	PDGFRA-CDK5RAP2 Fusion	PDGFRA-ETV6 Fusion	PDGFRA-FIP1L1 Fusion	PDGFRA-Fusions	PDGFRA-KDR Fusion
PDGFRA-KIF5B Fusion	PDGFRA-STRN Fusion

PDGFRB融合基因
AGGF1-PDGFRB Fusion	ATF7IP-PDGFRB Fusion	BIN2-PDGFRB Fusion	CEP85L-PDGFRB Fusion	EBF1-PDGFRB Fusion	ETV6-PDGFRB Fusion
GIT2-PDGFRB Fusion	GOLGA4-PDGFRB Fusion	GPIAP1-PDGFRB Fusion	HIP1-PDGFRB Fusion	KANK1-PDGFRB Fusion	KIAA1509-PDGFRB Fusion
NIN-PDGFRB Fusion	PDE4DIP-PDGFRB Fusion	PRKG2-PDGFRB Fusion	RABEP1-PDGFRB Fusion	SPTBN1-PDGFRB Fusion	TP53BP1-PDGFRB Fusion
WDR48-PDGFRB Fusion

RAD51B融合基因
RAD51B-HMGA2 Fusion

RET融合基因
RET-CCDC6 Fusion	RET-EML4 Fusion	RET-Fusions	RET-KIF5B Fusion	RET-NCOA4 Fusion	RET-SEPTIN9 Fusion
RET-RUFY1 Fusion

ROS1融合基因
CCDC6-ROS1 Fusion	CD74-ROS1 Fusion	CEP85L-ROS1 Fusion	EZR-ROS1 Fusion	FIG-ROS1 Fusion	GOPC-ROS1 Fusion
KDELR2-ROS1 Fusion	LIMA1-ROS1 Fusion	LRIG3-ROS1 Fusion	MSN-ROS1 Fusion	SDC4-ROS1 Fusion	SLC34A2-ROS1 Fusion
TFG-ROS1 Fusion	TPM3-ROS1 Fusion	YWHAE-ROS1 Fusion

客户成果
案例分析
- 融合基因（Fusion）标准品细胞株（DNA层面）
  KIF5B-ALK融合基因标准品细胞株
  
  融合基因（Fusion）标准品细胞株（RNA层面）
  KIF5B-RET融合基因标准品细胞株
参考文献