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做过基因敲除细胞株研究的科学家都了解,敲除细胞单克隆是一个非常不好做的实验,因为不是每种细胞都能够长单克隆,而且很多能够形成克隆的细胞的单克隆形成率很低(低于5%也是很常见的)。

如果放到细胞系基因编辑(细胞基因:敲除 | 敲入 | 突变 )这个领域里面一个非常大的限制瓶颈就是:细胞的克隆形成率!

如果我们通过简单的数学模型来重现这个过程就知道克隆形成率有多么的重要:

细胞敲除效率与基因数和克隆形成率

由于基因敲除效率%(E)是一个固定的常数:只和基因的 位置,基因功能,gRNA的选择,选择的方法论等有关;

细胞基因拷贝数(N):不同的细胞株,不同来源的细胞的克隆拷贝数不一样,很多细胞都不是二倍体;

所以克隆形成率(C):直接影响到敲除效率的高低,也是基因编辑效率高低比较直接的一个系数;

ClonePlus是海星生物平台的研发人员经过两年时间研究,就是为了彻底解决细胞克隆形成率对基因编辑效率的影响。最终将C系数固定在:0.98-1,从而大幅的提升了基因编辑和基因敲除的有效率,大幅加速了服务的过程。

主要的提升克隆形成率的核心要素包括:

1、筛选状态良好稳定的细胞株作为使用的细胞株;

2、筛选更加高效的克隆形成培养基和培养粘附材质,直接解决了克隆形成的问题;

由于使用的都是片段敲除策略,优势是:大片段的DNA缺失,导致mRNA表达消失,从而保证了Western Blot更加问题(很多做移码敲除,最后都会出现WB的鉴定分析困难)。而要更好地维持片段敲除,单克隆化是必须的,ClonePlus正是我们平台解决该难题的核心技术。

虽然ClonePlus技术的研发过程充满了困难,但是现在我们终于可以为客户通过高效、快速、有保证的服务,也是我们的骄傲。

ClonePlus™验证过的细胞株


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